Een point-of-care COVID-19-test ontwikkeld door onderzoekers van de University of Illinois Urbana-Champaign kan nu de alfa-variant van het SARS-CoV-2-virus detecteren en onderscheiden van eerdere stammen in speekselmonsters.
De nieuwe test bouwt voort op de eerdere ontwikkelingen van de groep, waardoor monsters het laboratorium konden omzeilen – eerst met behulp van nasofaryngeale uitstrijkjes en vervolgens met speekselmonsters. Het point-of-care amplificatie- en testproces, LAMP genaamd, is efficiënter dan PCR omdat er geen dure thermische cyclische machines voor nodig zijn. De onderzoekers zeiden dat de test geen RNA-extractie- en zuiveringsstappen nodig heeft, vergelijkbaar met de speekseltest in Illinois.
De resultaten van de studie, mede geleid door Rashid Bashir, een professor in bio-engineering en de decaan van het Grainger College of Engineering in Illinois, mechanische wetenschappen en engineering professor Bill King en bio-engineering professor Enrique Valera, zijn gepubliceerd in het tijdschrift Lab op een Chip.
“Onze studie toont aan dat het mogelijk is om op varianten van dezelfde coronavirusstam te testen in een enkele point-of-care-test die 30 minuten duurt met een draagbaar handheld-apparaat”, zei Bashir. “De nieuwe test is schaalbaar voor toekomstige pandemieën, COVID-19 of anderszins, en kan thuis of in andere omgevingen worden gebruikt.”
Het bijgewerkte proces maakt gebruik van een genetisch fenomeen genaamd S-gen-doelfalen – dat aanwezig is in de alfa-variant maar niet in de vroege stammen van het SARS-CoV-2-virus – om onderscheid te maken tussen de twee alfa-varianten, aldus de onderzoekers.
“De nieuwe omicron-variant vertoont ook falen van het S-gen-doel en kan worden getest door de in deze studie ontwikkelde benadering aan te passen,” zei Valera.
advertentie
Tijdens het nieuwe testproces worden speciaal geselecteerde genetische primers op additief vervaardigde cartridges geplaatst en gedroogd voordat de patiëntmonsters worden toegevoegd. De gekozen primers zijn ingesteld tegen het S-gen en zijn specifiek voor het detecteren van het falen van het S-gen-doelwit tegen 69-70 deletie in de alfa-variant, meldt de studie.
De studie bevestigde de effectiviteit van het apparaat door 38 klinische speekselmonsters te testen, waaronder 20 monsters die positief waren voor de alfavariant.
De onderzoekers zeiden dat ze hun methode zouden willen verfijnen om tot vijf verschillende virussen, virale stammen en varianten in één enkele test te testen, compatibel met neusuitstrijkjes en speekselmedia.
Co-auteurs van het artikel waren afgestudeerde studenten Jongwon Lim en Robert Stavins, en Karen White en James Kumar van het Carle Foundation Hospital.
Het door Foxconn Interconnect Technology gesponsorde Center for Networked
Intelligent Components and Environments van de University of Illinois Urbana-Champaign, de National Science Foundation en de National Institutes of Health ondersteunden deze studie. Klinische monsters werden verkregen van het Carle Foundation Hospital en de U. of I. COVID-19-detectiestudie.
De auteurs zijn ook verbonden aan elektrotechniek en computertechniek, het Beckman Institute for Advanced Science and Technology, het Carle Illinois College of Medicine, het Holonyak Micro and Nanotechnology Lab, het Cancer Center in Illinois, het Materials Research Laboratory en de Carl R. Woese Instituut voor Genomische Biologie.
Verhaalbron:
Materialen geleverd door Universiteit van Illinois in Urbana-Champaign. Origineel geschreven door Lois Yoksoulian. Opmerking: inhoud kan worden bewerkt voor stijl en lengte.
lees het gehele artikel bij de bron
————————————————– ———————————–
samenvatting:
Een door onderzoekers ontwikkelde point-of-care COVID-19-test kan nu de alfa-variant van het SARS-CoV-2-virus detecteren en onderscheiden van eerdere stammen in speekselmonsters.
Datum van publicatie: 20 april 2022
Bron: Klimaat | Top milieunieuws — ScienceDaily
————————————————– ———————————–